daug ginčo nagrinėjimo stadijų; labai ilgai užtrunkantis procesas (ypač LVAT)
atkrenta nekokybiški patikrinimai, prireikus anksčiau skiriami pakartotiniai patikrinimai, ginčus nagrinėja mokesčių specialistai (pirmos instancijos teisme teisėjai nesispecializuoja, todel daznai truksta kompetencijos ne tik mokesčių apskaičiavimo, bet ir pvz PVM sistemos suvokime
Greitesnis klausimo užbaigimas - taupomi kaštai ir laikas mokesčių mokėtojui; Taip pat būtent specializuotas mokestinių ginčų nagrinėjimas MGK yra gan kokybiškas būdas gauti išorinę nuomonę apie mokestinį klausimą ne vien tik iš teisinės pusės, bet ir su daugiau ekonominių įžvalgų (oalyginus su VAAT ir LVAT stadijomis po to)
Nemtau
Nematau.
Mažiau bylų teismuose, kur procesas labiau formalizuotas ir brangesnis